Можно отключить графический модуль защиты, это опция Miscellaneous - Other - Suppress Graphical Module, но читайте документацию, некоторые функции перестанут работать.
На счет антивируса, вот тут есть инструкции как отослать защищенный файл разработчикам антивируса чтобы они исправили проблему http://www.softwareprotection.info/2011 ... -to-solve/
Скоро выйдет версия 4.0 протектора, там уже будет встроена функция цифровой подписи файлов, специально для антивирусов, будет надеятся ложных детектов не будет совсем.